深孔鉆頭需要用專門的包裝盒包裝，防止震動相互撞擊。深孔鉆頭在應用中，從盒子中取出的鉆頭要放入主軸的彈性夾頭中或者鉆頭的數控刀片可以自動取出更換。用后放回包裝盒。應使用工具顯微鏡等非接觸式檢測儀器準確測量鉆頭直徑，防止鉆刃接觸踏板測試儀時碰傷。
有些數控鉆床用定位環，有些不用。例如，如果使用定位環，安裝過程中的深度定位必須準確。如果不使用定位環，主軸上鉆頭的延伸長度應調整一致。多軸刨床更要注意這一點，每個主軸的鉆孔深度要一致。如果不一致，可能會導致鉆頭鉆入柜臺或pcb電路板損壞。通常可以用40倍體視顯微鏡檢查鉆頭鉆刃的磨損情況。
鋼板層壓板包括上、下墊塊，刨床工作時要在手機定位系統中定位牢固，對準臺面上的一孔一槽。在膠粘產品的應用中，要防止鉆頭粘在膠帶上，造成銑鉆困難和斷鉆。從廠家購買鉆頭時，需要抽樣檢查4%的鉆頭在進廠時是否符合要求。用10 ~ 15倍光學顯微鏡檢查100%的缺陷、劃痕和裂紋。鉆頭的適度重磨可以提高鉆頭的使用和重磨頻率，增加鉆頭的使用壽命，降低產品成本和費用。用通用顯微鏡測量，在兩個主鉆刃的總長度內，磨損深度應小于0.2毫米。重磨時磨0.25mm。一般固定柄鉆頭可以重磨3次，鏟頭鉆頭可以重磨2次。打磨過多會降低沖壓質量和精度，導致pcb產品損壞。過度打磨的實際效果得不償失。
經常檢查主軸和彈性卡盤的同軸度以及彈性卡盤的夾緊力。同軸度不好，小直徑鉆頭會斷，直徑大。如果夾緊力不好，具體的轉速比就會和設定的轉速比不一致，夾頭就會偏離鉆頭。固定柄鉆頭在彈性卡盤上的夾緊長度為鉆柄直徑的4 ~ 5倍，才能夾緊牢固。務必檢查主軸壓腳。壓腳面要水平，與主軸垂直，不要晃動，以免鉆孔時斷鉆、偏孔。刨床的實際除塵效果更好。除塵風可以降低鉆頭溫度，朋友帶灰塵減少摩擦造成高溫。