深孔鉆頭要用專門的包裝盒包裝，防止震動相互碰撞。使用深孔鉆頭時，應將從包裝箱中取出的鉆頭放入主軸的彈性夾頭中或自動更換鉆頭的刀片。用后放回包裝盒。要準確測量鉆頭直徑，應使用工具顯微鏡等非接觸式檢測儀器，防止因接觸腳踏檢測儀而傷及鉆刃。
深孔鉆頭有些廠家的數控鉆床應用了定位環，有些數控鉆床沒有。例如，如果使用定位環，安裝過程中的深度定位必須準確。如果沒有使用定位環，安裝在主軸上的鉆頭的延伸長度應該調整到一致。多軸刨床更要注意這一點，每個主軸的鉆孔深度要一致。如果不一致，可能會導致鉆頭鉆入柜臺或鉆不透pcb電路板，造成損壞。通常，可以使用40x立體顯微鏡來檢查鉆頭鉆刃的磨損情況。
基礎鋼板層壓包括上下墊塊，在刨床工作臺上的一孔一槽手機定位系統中應定位牢固、準確。在使用膠粘產品時，要避免鉆頭粘在膠帶上，導致銑鉆困難和斷鉆。在購買廠家的鉆頭時，需要在進廠檢測時抽樣檢查是否有4%符合要求。并用10 ~ 15倍的光學顯微鏡100%檢查其空位、劃痕和裂紋。鉆頭的適度重磨可以提高鉆頭的使用和重磨頻率，增加鉆頭的使用壽命，降低產品成本和費用。用通用顯微鏡測量，在兩個主要鉆孔刃的總長度內，磨損深度應小于0.2毫米。重磨時，應去除0.25毫米。一般的固定柄鉆頭可以重磨三次，鏟頭鉆頭可以重磨兩次。打磨過多會降低沖壓質量和精度，導致pcb電路板產品損壞。過度打磨的實際效果得不償失。
經常檢查主軸和彈性卡盤的同軸度以及彈性卡盤的夾緊力。同軸度不好會導致小直徑鉆斷鉆，直徑大，夾緊力不好會導致比轉速比與設定轉速比有偏差。固定柄鉆在彈性卡盤上的夾緊長度為鉆柄直徑的4 ~ 5倍，才能夾緊牢固。務必檢查主軸壓腳。壓腳表面應水平并垂直于主軸，不允許晃動，以免鉆孔時出現鉆孔破損和孔偏。刨床的實際除塵效果更好。除塵風可以降低鉆頭溫度，朋友帶煙塵減少摩擦造成高溫。